52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3390 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  62.57 
 
 		 178 aa  249  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  56.61 
 
 		 211 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  56.12 
 
 		 210 aa  230  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  55.61 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  52.12 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  42.78 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  31.55 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  31.21 
 
 		 171 aa  87.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  30 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  30.18 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  33.09 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  31.03 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  30.18 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  31.72 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  30.94 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  30.94 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  31.11 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  30.22 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  30.83 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  30.53 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  30.06 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  33.96 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  33.07 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  23.95 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  29.45 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  29.01 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  28.65 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  24.55 
 
 		 443 aa  65.1  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  31.3 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  29.63 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  27.65 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  27.85 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  25.48 
 
 		 211 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  26.43 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  28.57 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  24.04 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  28.57 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  30.77 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  29.52 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  31.43 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  28.57 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  26.98 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  25.38 
 
 		 444 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  22.35 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  22.35 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  23.78 
 
 		 400 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  23.76 
 
 		 427 aa  47.8  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  21.91 
 
 		 610 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0426  cytochrome c family protein  27.1 
 
 		 916 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  26.04 
 
 		 458 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  25.73 
 
 		 790 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>