81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1192 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  100 
 
 
277 aa  552  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  58.56 
 
 
271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2007  Ion transport 2 domain protein  54.65 
 
 
270 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  31.14 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  30.74 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  33.75 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  25.8 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  29.95 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  27.31 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  28.04 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  26.61 
 
 
241 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  27.92 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  25.84 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  25.84 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  25.84 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  28.05 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  24.89 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  25.84 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  21.97 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  26.54 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  24.87 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  28.57 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  27.42 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  24.11 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  22.92 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  23.33 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  23.33 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  23.81 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  25.36 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  27.38 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  20.73 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  25.24 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  27.32 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0462  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  25.51 
 
 
216 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  28.64 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  31.16 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  28.64 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  26.32 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  24.88 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  28.76 
 
 
477 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  24.75 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  27.8 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  26.42 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  26.57 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  29.55 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  29.55 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  24.43 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4349  hypothetical protein  32.57 
 
 
236 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3864  ion transporter  24.6 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.611066 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.9 
 
 
531 aa  52.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  25.73 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  33.64 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  23.94 
 
 
517 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.27 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  22.88 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  26.92 
 
 
228 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.17 
 
 
409 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  27.87 
 
 
419 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  26.24 
 
 
212 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  21.18 
 
 
289 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  26.03 
 
 
302 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.01 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  22.57 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  21.18 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  21.18 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  32.04 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  25.48 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  28.12 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  25.53 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  26.14 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  22.53 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  22.53 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  22.53 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  22.53 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  27.78 
 
 
280 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  28.87 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  23.26 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  28.03 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88568  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily H  26.06 
 
 
962 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0730673  normal  0.0371223 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  27 
 
 
269 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>