47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0804 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.75 
 
 		 292 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  44.41 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  46.44 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  44.04 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  46.46 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  45.52 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  43.19 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  44.6 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  46.88 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.12 
 
 		 365 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  44.29 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  43.9 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  44.25 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  43.9 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  44.73 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.18 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  43.9 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  44.79 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  43.9 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  44.25 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  43.9 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  47.7 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  44.25 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  44.72 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.99 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  24.74 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  28.17 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  27.24 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  25.93 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  28.31 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  31.88 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  24.37 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  19.39 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.87 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.32 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  29.67 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  30.06 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>