177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0604 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  40.43 
 
 
183 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
199 aa  92  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  29.83 
 
 
203 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2146  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  24.46 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2303  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0543227  normal  0.375483 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.22 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.67 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  25.15 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.9 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  24.59 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
211 aa  57.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  25.41 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 
243 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  24.04 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
411 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  24.04 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  25.14 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  27.7 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.68 
 
 
420 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  31.78 
 
 
263 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  24.46 
 
 
252 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1485  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000041456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
397 aa  52  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
264 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1442  methyltransferase type 11  27.89 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0423534  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0377  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
225 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.790599  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  25 
 
 
251 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
310 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0437  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  23.46 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  25.56 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  25.55 
 
 
275 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.27 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0798  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1944  methyltransferase type 11  22.41 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
240 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
199 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  30.1 
 
 
263 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  24.29 
 
 
243 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  24.86 
 
 
255 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
272 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  27.89 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
256 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  24.71 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  29.29 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
317 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
256 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  23.46 
 
 
278 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  25.32 
 
 
268 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  26.99 
 
 
309 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.67 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
208 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  23.29 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  22.64 
 
 
246 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  25.2 
 
 
248 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
275 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  26.76 
 
 
247 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  28.48 
 
 
341 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 
240 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  23.16 
 
 
244 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
254 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
233 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.79 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  23.24 
 
 
310 aa  45.1  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  21.56 
 
 
237 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  26.74 
 
 
272 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  30.32 
 
 
199 aa  44.7  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
258 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  21.66 
 
 
262 aa  44.7  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>