30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0567 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  100 
 
 		 129 aa  266  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  50 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  43.09 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  50 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  38.46 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  42.22 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  40 
 
 		 545 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  37.04 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  35.11 
 
 		 224 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  33.61 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  34.45 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  33.75 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  37.5 
 
 		 555 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  38.55 
 
 		 556 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  28.57 
 
 		 538 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  46.67 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0847  hypothetical protein  27.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00928688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  29.17 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  30.25 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  31.07 
 
 		 581 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  29.92 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  34.33 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  36.59 
 
 		 91 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.47 
 
 		 589 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  39.19 
 
 		 514 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  35.8 
 
 		 266 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  26.14 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  32.17 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  25.16 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>