29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0168 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  100 
 
 		 333 aa  686    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  52.69 
 
 		 343 aa  345  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  49.65 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  43.39 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  37.42 
 
 		 2002 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  35.21 
 
 		 670 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  35.56 
 
 		 409 aa  95.9  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  34.02 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.66 
 
 		 746 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  33.58 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  33.54 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.53 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  30.41 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  28.86 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  32.12 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.05 
 
 		 1035 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1022 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  34.41 
 
 		 130 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  23.88 
 
 		 587 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1152 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  32.1 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 814 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  32 
 
 		 165 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  26.03 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2070  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  30.34 
 
 		 946 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  31.65 
 
 		 1310 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  30.97 
 
 		 181 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>