35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2561 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2238  DNA repair exonuclease-like protein  82.56 
 
 		 436 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74733  normal  0.111488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  100 
 
 		 445 aa  897    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1567  metallophosphoesterase  71.39 
 
 		 426 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0723248  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5276  DNA repair exonuclease-like protein  53.28 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1635  DNA repair exonuclease-like protein  53.28 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6788  DNA repair exonuclease-like protein  51.09 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6220  DNA repair exonuclease-like protein  52.17 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4318  DNA repair exonuclease-like protein  47.3 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3732  DNA repair exonuclease-like protein  44.39 
 
 		 448 aa  322  9.000000000000001e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25.84 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  28.23 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  25.57 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.8 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  24.31 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  25.57 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  28.49 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  23.68 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  25.34 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  28.03 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  28.16 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  29.43 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  25.87 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  23.61 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  27.34 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  29.83 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  32.71 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  23.1 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.79 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  20.28 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  23.1 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  19.93 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  32.74 
 
 		 245 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  25.63 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>