121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4843 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  624  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  84.72 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  84.72 
 
 		 332 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  78.42 
 
 		 328 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  67.48 
 
 		 311 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  70.37 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  72.07 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  65.12 
 
 		 304 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  71.17 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  65.66 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  67.5 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  70.46 
 
 		 304 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  67.48 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  65.34 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  64.07 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  64.11 
 
 		 307 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  64.91 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  63.58 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  64.09 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  67.02 
 
 		 304 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  59.2 
 
 		 306 aa  361  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  59.94 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  59.94 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  59.94 
 
 		 303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  59.02 
 
 		 303 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  60.19 
 
 		 319 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  59.33 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  64 
 
 		 313 aa  351  8e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  61.42 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  57.89 
 
 		 303 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  62.11 
 
 		 305 aa  347  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  57.23 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  57.54 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  61.02 
 
 		 302 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  57.23 
 
 		 305 aa  346  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  57.23 
 
 		 305 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  57.23 
 
 		 305 aa  345  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  57.23 
 
 		 305 aa  345  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  57.23 
 
 		 305 aa  345  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2772  hypothetical protein  62.08 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  59.08 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  56.66 
 
 		 314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  56.59 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  56.33 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  56.02 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  56.33 
 
 		 308 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  56.29 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  55.36 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  56.33 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  57.31 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  57.53 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  57.53 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  55.52 
 
 		 307 aa  323  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  55.79 
 
 		 321 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  56.72 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  63.12 
 
 		 307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  54.43 
 
 		 301 aa  318  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  54.6 
 
 		 307 aa  318  9e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  56.75 
 
 		 307 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  56.02 
 
 		 301 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  55.38 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  54.82 
 
 		 341 aa  308  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  55.18 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  54.23 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  52.85 
 
 		 301 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  55.45 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  51.48 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  57.3 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00476  hypothetical protein  54.03 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  52.52 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0228  hypothetical protein  49.54 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0229  hypothetical protein  49.54 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  45.39 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  41.75 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  39.88 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  43.93 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2963  protein of unknown function DUF808  42.62 
 
 		 288 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000127698  hitchhiker  0.0000000223824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  45.88 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  41.25 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  41.14 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  42.77 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  38.38 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  43 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  47.73 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  40.69 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0430  hypothetical protein  32.09 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000210959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  39.69 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  44.79 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  44.15 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  44.15 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  44.15 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  46.54 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  41.21 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  40 
 
 		 345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  46.86 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  46.86 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  44.17 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  41.85 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  39.65 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  42.9 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>