160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2779 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  64.24 
 
 		 182 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  42.29 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  36.77 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  34.5 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  35.9 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  26.44 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  26.44 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  26.88 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  29.87 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  32.79 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  27.43 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  33.33 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  28.21 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  26.54 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.29 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  27.84 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  27.84 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.57 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  31.01 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.78 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  30.67 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  26.87 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.61 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.87 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  28.48 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  27.61 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  27.61 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  27.61 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  27.4 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  28.3 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  26.47 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  27.86 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  27.61 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.61 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  26.43 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.43 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  26.62 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  27.54 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.71 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.71 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.28 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  26.61 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.71 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.71 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.71 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.28 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.71 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.28 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.28 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.71 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  28.03 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.71 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  28.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25.77 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  26.43 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  25.19 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  32.05 
 
 		 528 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  24.46 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  28.57 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  24.7 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  24.32 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  27.5 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.79 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  26.12 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  27.74 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  28 
 
 		 325 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  27.91 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  27.64 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  26.71 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  24.53 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  25.4 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.96 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  24.82 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  27.74 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  27.82 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  25.49 
 
 		 518 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.36 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.39 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  27.1 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  29.79 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  21.18 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.39 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.39 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  32.18 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  24.5 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  25.16 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  26.05 
 
 		 331 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  22.97 
 
 		 515 aa  45.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.2 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  24.17 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  25.16 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  29.77 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  27.91 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  28.57 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>