More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4821 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 175 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 175 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  43.84 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  45.32 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  42.76 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  42.25 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.42 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  45 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  46.21 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  45.52 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  41.22 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  38.41 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  37.01 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  43.97 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0768  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 157 aa  103  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.36 
 
 		 166 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  41.33 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 171 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  43.75 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  43.88 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  43.75 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  39.29 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>