175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4271 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  40.17 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  32.64 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  32.95 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  28.4 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 282 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  28.4 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  28.9 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  28.9 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  29.1 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  26.89 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  26.32 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  26.52 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  27.16 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 659 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 139 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 139 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 139 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 92 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  36.05 
 
 		 368 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 157 aa  48.9  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  25.88 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 630 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 630 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  28.23 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 166 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 126 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  30.5 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  40.58 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 133 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.78 
 
 		 136 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 122 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  34.38 
 
 		 122 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 147 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 130 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 136 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 142 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 142 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  39.71 
 
 		 145 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 175 aa  45.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 183 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>