More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3938 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3938  ABC transporter related protein  100 
 
 
839 aa  1623    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  33.53 
 
 
861 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.76 
 
 
499 aa  360  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  41.33 
 
 
512 aa  360  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.76 
 
 
514 aa  357  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  39.38 
 
 
513 aa  352  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.57 
 
 
519 aa  347  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.51 
 
 
501 aa  347  7e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  38.76 
 
 
501 aa  347  8e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.16 
 
 
501 aa  346  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  38.28 
 
 
499 aa  345  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  36.95 
 
 
495 aa  345  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  38.76 
 
 
501 aa  344  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.99 
 
 
506 aa  343  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  38.79 
 
 
503 aa  342  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.49 
 
 
513 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  40.75 
 
 
511 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
504 aa  340  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  37.09 
 
 
504 aa  340  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.18 
 
 
507 aa  340  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.69 
 
 
501 aa  340  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  38.69 
 
 
501 aa  340  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  38.69 
 
 
501 aa  340  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  38.69 
 
 
501 aa  340  9e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
501 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  38.49 
 
 
501 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.6 
 
 
512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  38.29 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.18 
 
 
510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  40.93 
 
 
508 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  38.29 
 
 
516 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  38.29 
 
 
516 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  38.29 
 
 
501 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  40.64 
 
 
509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  38.29 
 
 
516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  38.49 
 
 
501 aa  337  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  38.49 
 
 
499 aa  337  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
499 aa  337  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  37.55 
 
 
494 aa  337  7.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  39.31 
 
 
501 aa  336  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  38.29 
 
 
501 aa  336  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  39.63 
 
 
503 aa  336  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.78 
 
 
495 aa  335  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  42.89 
 
 
508 aa  334  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.72 
 
 
503 aa  333  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.4 
 
 
523 aa  333  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  36.55 
 
 
501 aa  333  8e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  35.74 
 
 
501 aa  333  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
499 aa  333  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.49 
 
 
517 aa  333  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  39.18 
 
 
513 aa  333  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
505 aa  333  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
521 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.95 
 
 
520 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  35.15 
 
 
495 aa  332  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  39.08 
 
 
511 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  35.71 
 
 
499 aa  332  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  38.78 
 
 
513 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.08 
 
 
511 aa  332  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.16 
 
 
524 aa  331  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  38.26 
 
 
509 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2744  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
501 aa  330  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39.36 
 
 
501 aa  330  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  37.9 
 
 
499 aa  330  9e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  39.38 
 
 
512 aa  330  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.9 
 
 
499 aa  330  9e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  36.09 
 
 
501 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  37.96 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  36.4 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  38.29 
 
 
501 aa  328  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  35.73 
 
 
496 aa  328  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  38.1 
 
 
503 aa  327  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  37.9 
 
 
494 aa  327  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.44 
 
 
516 aa  327  8.000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
497 aa  326  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  41.09 
 
 
494 aa  326  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
525 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 
517 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  36.82 
 
 
500 aa  326  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.17 
 
 
495 aa  325  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  39.83 
 
 
513 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4627  ABC transporter related  41.35 
 
 
505 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  37.25 
 
 
496 aa  325  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39.05 
 
 
524 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  39.05 
 
 
524 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  40.28 
 
 
503 aa  324  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  36.88 
 
 
498 aa  324  5e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
496 aa  324  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  38.48 
 
 
525 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.84 
 
 
524 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  38.97 
 
 
501 aa  323  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.08 
 
 
503 aa  323  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  41.14 
 
 
498 aa  323  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  35.43 
 
 
494 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  40.52 
 
 
513 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  39.17 
 
 
519 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  38.28 
 
 
511 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  35.83 
 
 
501 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
494 aa  321  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
494 aa  321  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>