More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3755 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  100 
 
 
128 aa  259  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
129 aa  136  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 
126 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  51.24 
 
 
126 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
129 aa  133  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 
130 aa  133  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 
125 aa  133  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 
126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 
126 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 
128 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 
128 aa  129  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
126 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  48.84 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 
126 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 
126 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
131 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  55.26 
 
 
123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 
131 aa  126  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  48.28 
 
 
134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  44.53 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 
128 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 
125 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 
128 aa  124  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 
123 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 
121 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 
120 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 
120 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 
126 aa  124  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 
125 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 
120 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 
126 aa  124  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  51.72 
 
 
124 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  124  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 
127 aa  123  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
129 aa  123  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
121 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 
126 aa  123  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 
125 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  47.37 
 
 
134 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 
128 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  122  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 
127 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
127 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
126 aa  121  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 
127 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  52.21 
 
 
122 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 
130 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44.53 
 
 
135 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
129 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
129 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 
121 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 
127 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 
135 aa  120  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 
134 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 
126 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  54.46 
 
 
122 aa  120  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  48.28 
 
 
121 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 
128 aa  120  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>