161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2995 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2995  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
261 aa  484  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6933  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.97 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1606  RNA methyltransferase  27.45 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0012787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.71 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.51 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.44269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21880  rRNA methylase  38.51 
 
 
295 aa  62.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  26.8 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.68 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2415  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.47 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05470  rRNA methylase  38.5 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.29 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.64 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.53 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  26.4 
 
 
257 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4141  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.37 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000328587  hitchhiker  0.000303347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11661  23S rRNA methyltransferase tsnR  36.02 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.55 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1483  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.55 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0863  rRNA (adenosine-2'-O-)-methyltransferase  35.56 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.833783  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0599  rRNA methylase  29.68 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.441965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  35 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5480  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.36 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666691  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0294  rRNA methyltransferase  28.21 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000126477  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0612  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.84 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.356127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22400  rRNA methylase  36.81 
 
 
280 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.13 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.560125  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.79 
 
 
266 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21660  rRNA methylase  30.48 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.41 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.87191  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.97 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.29 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1877  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.6 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.59 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  29.35 
 
 
365 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1878  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.38 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01710  rRNA methylase  34.88 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.43805 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04950  rRNA methylase  30.59 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0863  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.66 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0025  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.76 
 
 
286 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5673  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.78 
 
 
332 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.75 
 
 
314 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114831  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0417  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  23.77 
 
 
264 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1870  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.77 
 
 
279 aa  52  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  26 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0623  rRNA methylase  23.72 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.11 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  27.49 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0414  rRNA methylase  29.87 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2264  putative rRNA methylase  34.29 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.16 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.38 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.16 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5195  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.3 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.58 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1480  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.73 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0815881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.73 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.13 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  31.2 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  27.09 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.79 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  23.18 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2462  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.45 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1311  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.68 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.662329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.94 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.914691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  25.39 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2845  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.25 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3094  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.74 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922753  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.31 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  27.35 
 
 
254 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  27.09 
 
 
265 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  28.43 
 
 
333 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6302  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.46 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  26.69 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  26.88 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.52 
 
 
276 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  26.69 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1437  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.39 
 
 
235 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418693  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49741  predicted protein  29.71 
 
 
343 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0683  spoU rRNA methylase family protein  22.53 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.827085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1225  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.19 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  32.88 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1627  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.2 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1178  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.16 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.62 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.666902  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0856  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.97 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  27.73 
 
 
349 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0769  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.34 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.33 
 
 
266 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199948  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1357  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.11 
 
 
260 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2137  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.44 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1614  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.59 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329704  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5470  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.67 
 
 
282 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.28 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0955758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.14 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.71 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1735  SpoU rRNA methylase family protein  27 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33920  rRNA methylase  32.2 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15820  rRNA methylase  31.25 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.582235  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  28.29 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49451  predicted protein  31.03 
 
 
389 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>