More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4141 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4141  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
271 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000328587  hitchhiker  0.000303347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1878  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.34 
 
 
296 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25660  rRNA methylase  52.61 
 
 
257 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.76 
 
 
289 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11661  23S rRNA methyltransferase tsnR  54.51 
 
 
260 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2415  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.21 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  50.19 
 
 
275 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.48 
 
 
314 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114831  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5470  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.43 
 
 
282 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.31 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.246575  normal  0.0568105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
248 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2845  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.65 
 
 
269 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2978  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
248 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3022  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
248 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.19 
 
 
261 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3539  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.01 
 
 
252 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0474859  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.35 
 
 
236 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5480  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.8 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666691  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2039  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  47.57 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.928617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3179  tRNA/rRNA methyltransferase  50.38 
 
 
297 aa  194  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124408  normal  0.188856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2462  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.06 
 
 
237 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.65 
 
 
283 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.914691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1483  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.7 
 
 
297 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3166  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.62 
 
 
264 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.197409  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.05 
 
 
310 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172657  hitchhiker  0.00167697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.35 
 
 
276 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1480  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.61 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0815881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1627  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.36 
 
 
271 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22400  rRNA methylase  41.75 
 
 
280 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1106  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.22 
 
 
275 aa  156  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0367353  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2382  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.06 
 
 
254 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1319  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.16 
 
 
301 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134831  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14560  rRNA methylase  40.48 
 
 
298 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21880  rRNA methylase  36.46 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0417  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.06 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  29.55 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.36 
 
 
266 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.74 
 
 
286 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.85 
 
 
246 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.85 
 
 
246 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.5 
 
 
251 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.85 
 
 
267 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.23 
 
 
286 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.87191  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0537  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.47 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0842858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.47 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0820  rRNA methylase  33.45 
 
 
292 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.931958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.96 
 
 
272 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000452495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0414  rRNA methylase  35.23 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1207  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.84 
 
 
270 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0784669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  31.66 
 
 
246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  27.52 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0915  rRNA methylase  30.45 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00701819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.05 
 
 
254 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2613  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.71 
 
 
285 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.62 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  29.46 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1394  rRNA methylase  32.67 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  hitchhiker  1.76373e-23 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.06 
 
 
270 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.625975  normal  0.133256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3094  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.81 
 
 
262 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922753  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  29.55 
 
 
274 aa  110  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.7 
 
 
286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.63 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  27.8 
 
 
257 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0294  rRNA methyltransferase  30.53 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000126477  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  32.02 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  31.1 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  32.02 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  31.1 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  31.1 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0670  RNA methyltransferase, TrmH family  28.62 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  31.1 
 
 
254 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.52 
 
 
270 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
266 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199948  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  31.1 
 
 
254 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1606  RNA methyltransferase  32.08 
 
 
247 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0012787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1753  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
272 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0368079  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  31.1 
 
 
265 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  31.1 
 
 
254 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3145  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.22 
 
 
260 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00100034  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.45 
 
 
254 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.5 
 
 
261 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  30.71 
 
 
254 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.74 
 
 
260 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.18 
 
 
254 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0025  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32 
 
 
286 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.55 
 
 
269 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  30.71 
 
 
265 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0623  rRNA methylase  28.79 
 
 
252 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3823  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.82 
 
 
261 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0827889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.08 
 
 
251 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  35.8 
 
 
234 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12280  rRNA methylase  37.96 
 
 
229 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0215447  normal  0.0953277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0856  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.25 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.84 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.46 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02637  rRNA methyltransferase  26.01 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  27.05 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.39 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0173286  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1221  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.71 
 
 
258 aa  95.5  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000766628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  32.13 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>