58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2871 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2871  TipAS antibiotic-recognition  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  71.86 
 
 		 254 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  69.64 
 
 		 254 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  67.66 
 
 		 254 aa  235  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  67.07 
 
 		 255 aa  230  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  64.02 
 
 		 253 aa  216  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  55.21 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 256 aa  107  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 241 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 245 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  40.48 
 
 		 243 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  40.85 
 
 		 243 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  40.85 
 
 		 243 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  39.29 
 
 		 243 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  40.85 
 
 		 243 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  40.85 
 
 		 244 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  40.85 
 
 		 244 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  40.24 
 
 		 243 aa  95.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  40.24 
 
 		 243 aa  95.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.32 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  29.38 
 
 		 253 aa  67.4  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  30.06 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  30.06 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  29.34 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  30.77 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  28.03 
 
 		 258 aa  57.4  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  26.44 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  28.74 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  28.22 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 251 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  28.12 
 
 		 253 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  27.11 
 
 		 259 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 257 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  25 
 
 		 278 aa  51.2  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  24.84 
 
 		 274 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  23.84 
 
 		 262 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 268 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  27.22 
 
 		 254 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  23.35 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  25.45 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 258 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  27.91 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  24.85 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  24.54 
 
 		 249 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>