More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1412 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  80.96 
 
 		 394 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  81.98 
 
 		 394 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 394 aa  815    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  75.63 
 
 		 394 aa  639    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  70.92 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  69.15 
 
 		 391 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  67.79 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  68.05 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  64.87 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  67.79 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  67.53 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  67.53 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  67.53 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  67.53 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  67.53 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  67.53 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  65.97 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 409 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  63.97 
 
 		 409 aa  532  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  64.1 
 
 		 401 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  63.33 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  64.75 
 
 		 401 aa  531  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 402 aa  531  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  66.49 
 
 		 394 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  65.97 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  67.19 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 404 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  63.33 
 
 		 409 aa  528  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  65.97 
 
 		 394 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 406 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  67.48 
 
 		 373 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  65.45 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  65.01 
 
 		 401 aa  521  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60.36 
 
 		 402 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 		 402 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 411 aa  514  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 406 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 389 aa  512  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 408 aa  511  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  62.14 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  64.92 
 
 		 388 aa  510  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  62.98 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  61.86 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 413 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 400 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1349  tryptophan synthase, beta subunit  63.82 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 406 aa  504  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 411 aa  504  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 403 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  62.24 
 
 		 455 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  62.99 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 409 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 		 425 aa  501  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>