294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0957 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0957  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
99 aa  193  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  48.19 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  50.65 
 
 
99 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  47.13 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  34.83 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  38.95 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0531  preprotein translocase, YajC subunit  51.76 
 
 
93 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  37.23 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  39.33 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  41.57 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  32.98 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  39.18 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  39.53 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  43.06 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  41.49 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  42.67 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  40.43 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  34.83 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  41.43 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  41.49 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  39.29 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  43.04 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  40.28 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  39.56 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  38.3 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  44.12 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  40.43 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  41.43 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  38.3 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  37.35 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  32.97 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  32.26 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  43.42 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  38.75 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  38.75 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1605  preprotein translocase, YajC subunit  41.43 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.257286  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40.23 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  39.36 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  35.96 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  36.73 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  39.36 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1117  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  35.96 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  39.36 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  39.36 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1276  protein translocase subunit yajC  33.72 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142603  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>