291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1117 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1117  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 141 aa  283  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 116 aa  94.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  36.36 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  37.96 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  43.56 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  36.63 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  39.22 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  39.22 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  28.07 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  35.96 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  31.67 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  39.8 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  31.78 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  41.46 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  41.46 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.36 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  35.85 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36.26 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  31.58 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  37.25 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  39.58 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  36.04 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  37.33 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  35.16 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  39.58 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  35.16 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  39.58 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  31.43 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  34.48 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  33.67 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  32.58 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  34.31 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  35.87 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  35.23 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  32.63 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  32.63 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  33.7 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  35 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  31.31 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  30.09 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  34.02 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  40.7 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  28.28 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  29.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  28.24 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  29.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  28.24 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  30.11 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>