More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1756 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
377 aa  758    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.76 
 
 
379 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.4 
 
 
376 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.16 
 
 
377 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.59 
 
 
380 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.74 
 
 
380 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.74 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.24 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.71 
 
 
382 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  54.71 
 
 
382 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  54.71 
 
 
382 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  54.71 
 
 
382 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.97 
 
 
382 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  54.71 
 
 
382 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  54.71 
 
 
382 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  53.66 
 
 
382 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  53.14 
 
 
382 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.6 
 
 
378 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.03 
 
 
378 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  52.94 
 
 
370 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  53.14 
 
 
382 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.97 
 
 
382 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.24 
 
 
378 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  54.19 
 
 
382 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  53.14 
 
 
382 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.98 
 
 
378 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 
382 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.4 
 
 
378 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  52.25 
 
 
378 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.98 
 
 
378 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.72 
 
 
378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 
378 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  42.18 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
381 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
381 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 
383 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
381 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  40.43 
 
 
386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
381 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  39.63 
 
 
386 aa  262  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
381 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 
377 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 
383 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.13 
 
 
392 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
389 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
378 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
389 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
382 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
388 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
384 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.56 
 
 
388 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
394 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 
384 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
388 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  36.5 
 
 
383 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 
389 aa  225  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
388 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.34 
 
 
382 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.6 
 
 
382 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
392 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  36.05 
 
 
384 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
382 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  38.44 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 
390 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
387 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
387 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.05 
 
 
389 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
387 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.79 
 
 
389 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
393 aa  216  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  37.31 
 
 
383 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  34.92 
 
 
389 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
388 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  36.24 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 
387 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
388 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
383 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
381 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
382 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35.45 
 
 
381 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
388 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
382 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
382 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
383 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
384 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
382 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>