182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0624 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  100 
 
 		 152 aa  300  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  48.55 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  38.36 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  48.63 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  40 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  48.89 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  38.62 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  36.24 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  43.48 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  34 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  37.5 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  37.76 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  37.12 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  41.84 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  37.12 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  34.29 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  36.72 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  42.03 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  40.3 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  38.46 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  40.28 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  40.6 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  43.75 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  41.67 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  39.58 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  39.16 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  34.11 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  38.46 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  38.89 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  35.77 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  34.15 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  34.15 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  39.19 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  34.15 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  38.89 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  42.86 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  38.06 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  34.53 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  38.13 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  41.79 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  37.32 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  37.68 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  30.71 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  40.77 
 
 		 293 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  38.81 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  36.03 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  41.6 
 
 		 289 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  41.6 
 
 		 293 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  32.28 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  42.11 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  40.8 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  36.29 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  40.8 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  40.8 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  35.57 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  40 
 
 		 285 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  31.72 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  26.8 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  32.41 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  36.13 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  36.09 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  36.03 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  34.84 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  27.81 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  40 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  40.13 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  40.13 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1126  regulatory protein RecX  34.78 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  34.06 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  33.57 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  29.34 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  39.52 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  39.52 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1127  regulatory protein RecX  34.78 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  39.52 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  39.52 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  39.52 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  39.52 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  36.17 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  38.71 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  36.17 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  28.49 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  39.52 
 
 		 327 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  32.17 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  32.17 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  30.26 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  30.26 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  30.26 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  30.26 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  30.26 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3429  regulatory protein RecX  33.61 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>