More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6961 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  100 
 
 		 278 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  38.43 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  33.58 
 
 		 278 aa  175  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  33.83 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1202  aminotransferase class IV  32.43 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  34.08 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  32.1 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.98 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  32.8 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  26.67 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.69 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.75 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  30.38 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  35.02 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.1 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 292 aa  98.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  27.11 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  30.45 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  25.26 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  26.94 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.65 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  29.48 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  25.83 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  26.12 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  28.52 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  29.48 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  29.48 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  26.12 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  29.48 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  26.12 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  29.48 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  29.48 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  27.97 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 297 aa  92.4  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  29.48 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.28 
 
 		 290 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.57 
 
 		 290 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  25.75 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  30.48 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  28.52 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  30.4 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  31.9 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  29.75 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  25.75 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  25.75 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  29.25 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.65 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.82 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.81 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  26.71 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  26.46 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  28.41 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.46 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.46 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  27.82 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.82 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.85 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  30.19 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.05 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 287 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.9 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  27.71 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.46 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.46 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  26.46 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.46 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.61 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  25.37 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  28.35 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.63 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  29.21 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  26.89 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  29.21 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>