31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4712 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  100 
 
 		 712 aa  1471    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  42.24 
 
 		 713 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  42.16 
 
 		 311 aa  234  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  38.82 
 
 		 303 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  41.01 
 
 		 679 aa  203  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  28.69 
 
 		 623 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  31.26 
 
 		 669 aa  184  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  34.19 
 
 		 361 aa  182  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  35.05 
 
 		 318 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  32.85 
 
 		 788 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  33.13 
 
 		 425 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  34.39 
 
 		 455 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  29.86 
 
 		 334 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  31.77 
 
 		 311 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  28.21 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  28.86 
 
 		 351 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  28.47 
 
 		 312 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  43.45 
 
 		 327 aa  101  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  28.66 
 
 		 338 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  27.36 
 
 		 306 aa  91.3  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  29.31 
 
 		 354 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  28.86 
 
 		 355 aa  89.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  40.15 
 
 		 288 aa  88.2  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  29.05 
 
 		 294 aa  87.4  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  32.47 
 
 		 327 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  28.02 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  25.8 
 
 		 279 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  43.88 
 
 		 311 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  30.9 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  29.53 
 
 		 559 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>