74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1674 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  100 
 
 		 810 aa  1662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  29.95 
 
 		 772 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  29.75 
 
 		 766 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  29.63 
 
 		 774 aa  364  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  27.41 
 
 		 767 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  29.8 
 
 		 762 aa  330  5.0000000000000004e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  26.79 
 
 		 808 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  27.6 
 
 		 769 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  29.4 
 
 		 809 aa  258  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  27.74 
 
 		 875 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  26.44 
 
 		 811 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  23.39 
 
 		 858 aa  228  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  25.33 
 
 		 775 aa  224  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  26.55 
 
 		 851 aa  224  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  26.92 
 
 		 745 aa  218  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  26.98 
 
 		 806 aa  214  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  26.44 
 
 		 853 aa  207  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  23.93 
 
 		 780 aa  196  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  25.15 
 
 		 761 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  23.11 
 
 		 803 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  26.69 
 
 		 722 aa  124  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  23.18 
 
 		 730 aa  105  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  23.91 
 
 		 741 aa  95.9  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  36.61 
 
 		 743 aa  92  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  23.79 
 
 		 725 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  35.71 
 
 		 734 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  21.98 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  22.64 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  29.94 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.98 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  22.37 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  28.65 
 
 		 787 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.48 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  27.84 
 
 		 787 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.37 
 
 		 791 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 610 aa  54.7  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  33.9 
 
 		 428 aa  53.9  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.82 
 
 		 784 aa  51.6  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  32.82 
 
 		 784 aa  51.2  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  25.11 
 
 		 786 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  28.05 
 
 		 999 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  26.92 
 
 		 796 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  28.66 
 
 		 751 aa  49.3  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.68 
 
 		 772 aa  49.3  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 622 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.44 
 
 		 790 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.33 
 
 		 765 aa  48.5  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  29.77 
 
 		 763 aa  48.1  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  28.47 
 
 		 781 aa  47.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  23.78 
 
 		 795 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.89 
 
 		 787 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 835 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.76 
 
 		 808 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  30.25 
 
 		 790 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  20.93 
 
 		 1002 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.32 
 
 		 895 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 595 aa  45.8  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.22 
 
 		 811 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  24.46 
 
 		 794 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.61 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  21.99 
 
 		 769 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  28.47 
 
 		 788 aa  45.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.89 
 
 		 770 aa  45.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.32 
 
 		 769 aa  45.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3695  surface antigen (D15)  27.27 
 
 		 1128 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0630006  normal  0.0367539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.58 
 
 		 786 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  25.85 
 
 		 622 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  27.61 
 
 		 553 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  23.58 
 
 		 786 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  23.13 
 
 		 799 aa  44.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  32.59 
 
 		 702 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.59 
 
 		 784 aa  44.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  29.7 
 
 		 778 aa  44.7  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.41 
 
 		 797 aa  44.3  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>