257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2568 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.9 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.48 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.69 
 
 		 229 aa  101  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.31 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.13 
 
 		 238 aa  91.7  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.99 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  29.68 
 
 		 367 aa  75.5  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.5 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  31.14 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.67 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  36.67 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.67 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.43 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.17 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  32.58 
 
 		 361 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  33.06 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  34.11 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  33.06 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  29.59 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  34.17 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  30 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  31.28 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  32.23 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  32.5 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  32.5 
 
 		 362 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  34.17 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  34.17 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 		 357 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.33 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  26.59 
 
 		 383 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  32.77 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.89 
 
 		 372 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  33.88 
 
 		 392 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  33.59 
 
 		 414 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  34.68 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.1 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  30.13 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  31.67 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  27.74 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.56 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  30.13 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  31.78 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.89 
 
 		 398 aa  55.5  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  28.85 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  27.59 
 
 		 359 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  33.08 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  32.5 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  30.32 
 
 		 311 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  31.67 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  31.67 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  28.21 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.36 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.17 
 
 		 364 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  32.26 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  31.67 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.56 
 
 		 362 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.37 
 
 		 404 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  45 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.72 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.72 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  28.72 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  28.72 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  28.72 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  28.72 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  26.78 
 
 		 360 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.72 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  31.67 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.72 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.78 
 
 		 361 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  31.4 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  27.42 
 
 		 438 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  31.67 
 
 		 374 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  26.01 
 
 		 385 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  32.26 
 
 		 393 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  25.38 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  27.27 
 
 		 393 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  30.83 
 
 		 356 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.72 
 
 		 380 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  31.86 
 
 		 507 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  29.01 
 
 		 398 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  26.59 
 
 		 349 aa  52  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  30 
 
 		 314 aa  52  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  33.06 
 
 		 385 aa  51.6  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  26.01 
 
 		 360 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  29.41 
 
 		 550 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13540  hypothetical protein  28.76 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.156493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>