More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1015 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
280 aa  559  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6549  sugar ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000581927 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  36.64 
 
 
277 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
281 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
285 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
299 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
273 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
297 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
271 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
299 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 
290 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
305 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.84 
 
 
304 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
284 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
286 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
268 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  32.38 
 
 
308 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.82 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
278 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
281 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
273 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
297 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.22 
 
 
281 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
275 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
295 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
311 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316897  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
281 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302413  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0906  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.22 
 
 
283 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
315 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
290 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  32.84 
 
 
273 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
298 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
278 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
281 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
273 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
308 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413276 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
297 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
277 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603353  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
277 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
275 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
281 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
722 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
272 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  33.33 
 
 
272 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
301 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
311 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
298 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
280 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.11 
 
 
278 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  32.81 
 
 
280 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
278 aa  141  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
281 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00417189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
278 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
301 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.01 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0775264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3840  permease protein of sugar ABC transporter  33.48 
 
 
257 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0859974  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
295 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
291 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
276 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.75 
 
 
297 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
288 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
275 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
293 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
274 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
270 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  34.76 
 
 
278 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
285 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
271 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.45 
 
 
291 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
268 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
280 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
274 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
275 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
390 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  31.7 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.14 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
296 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5710  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.65 
 
 
280 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249557  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
289 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
291 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
297 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
296 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
299 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>