157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0400 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0400  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 106 aa  203  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  39.73 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.53 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  42.86 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  31 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  30.21 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.66 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  30.21 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  36.71 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.61 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  30 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.59 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.33 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  31.68 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  28.44 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  28.7 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  35 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  30.17 
 
 		 179 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  30.17 
 
 		 179 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.51 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  30.17 
 
 		 179 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  29.41 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  29.7 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  33.82 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  32.35 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.25 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  33.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  30.49 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  28.57 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  32.22 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  29.36 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  35.62 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.19 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  36.21 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  31.13 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  34.72 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  37.5 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  27.17 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  29.59 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  32.95 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  45.65 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  26.85 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  29.59 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  29.59 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.25 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  26.85 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  26.85 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  34.25 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  26.85 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  33.75 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  26.85 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  26.85 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  26.85 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  26.85 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.62 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.3 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.85 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  27.37 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.18 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.85 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.08 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.18 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  29.36 
 
 		 229 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  26.92 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  25.69 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.49 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  32.14 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  28.74 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  34.09 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.21 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.03 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  32.35 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  32.89 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  24.51 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.25 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.68 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.21 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  51.28 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  34.67 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.09 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  31.65 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.63 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  32.76 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.21 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  51.35 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0211  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.38 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  30.88 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  28.85 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  38.18 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  25.69 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.11 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>