54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1683 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 64 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  67.24 
 
 		 71 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  66.1 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  58.73 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  63.49 
 
 		 69 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  57.14 
 
 		 74 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  59.02 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  59.68 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  62.07 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  58.73 
 
 		 65 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1226  DNA binding domain-containing protein  62.5 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0533  DNA binding domain, excisionase family  34.48 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  33.82 
 
 		 73 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  34.62 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  31.37 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  34.78 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  31.48 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  32.61 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  30.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  28.85 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  23.21 
 
 		 676 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  32.61 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  34.69 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  30.77 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2798  DNA binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  30.43 
 
 		 69 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0674  molybdate-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 304 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.95042e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0996  DNA binding protein, excisionase family  36 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000176087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  32.65 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  29.41 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4283  DNA binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.979443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  33.96 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 		 67 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>