More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0642 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0642  cysteine synthase  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  52.16 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  55.67 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.64 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  53.87 
 
 		 320 aa  298  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 312 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  52.82 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  53.64 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.66 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  46.69 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  52.36 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  53.59 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51.52 
 
 		 320 aa  288  9e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  54.15 
 
 		 314 aa  286  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  50.51 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  49.16 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  52.63 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  49.49 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  53.82 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  51.32 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  47.84 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  52.3 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  47.51 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  52.63 
 
 		 319 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  52.32 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  53.29 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  49.49 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  51.16 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  54 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  52.49 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  51.34 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  51.34 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  50.83 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  51.18 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  50.99 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  50.33 
 
 		 313 aa  278  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  51.83 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  51.83 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  53.16 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  52.19 
 
 		 305 aa  278  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  52.16 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  50.66 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  48.15 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  51.83 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  53 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  50.17 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  51.48 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  49.67 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  47.7 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  47.7 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  46.67 
 
 		 299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  47.67 
 
 		 307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.01 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  50.97 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  50.34 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  47.81 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  51.52 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  52.16 
 
 		 311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  52.63 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  53.16 
 
 		 311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  46.33 
 
 		 299 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01951  O-acetylserine (thiol)-lyase A  51.31 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.958038  normal  0.621094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  52.3 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  50.49 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  53.47 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  51.5 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  47.16 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  47.32 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1490  cysteine synthase  50.98 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  50.33 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  51.5 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  53.72 
 
 		 312 aa  269  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  49.5 
 
 		 311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50 
 
 		 317 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  48.97 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  50.17 
 
 		 308 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  51.83 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  49.35 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  49.34 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  52.3 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  49.01 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  51.52 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  47.35 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  51.16 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  55.15 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  50.32 
 
 		 317 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  47.68 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  50.83 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 309 aa  266  5e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  51.49 
 
 		 329 aa  265  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  50.67 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>