More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0906 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  100 
 
 
367 aa  743    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  72.95 
 
 
367 aa  548  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1654  alanine dehydrogenase  70.77 
 
 
367 aa  494  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  55.07 
 
 
372 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 
373 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  53.61 
 
 
371 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  54.27 
 
 
377 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
377 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
377 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
377 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
377 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
377 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
377 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
377 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  52.62 
 
 
377 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 
377 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  51.23 
 
 
371 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  52.07 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  51.76 
 
 
369 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  51.77 
 
 
373 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  50.96 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  51.24 
 
 
377 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  52.17 
 
 
390 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
376 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 
373 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
377 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
371 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 
374 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  53.97 
 
 
370 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  54.42 
 
 
371 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  53.97 
 
 
370 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  49.72 
 
 
371 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  50.68 
 
 
371 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  50.68 
 
 
371 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  54.47 
 
 
363 aa  358  7e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  53.97 
 
 
370 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  50.68 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  50.28 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  52.22 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  50.56 
 
 
365 aa  355  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
372 aa  355  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 
372 aa  355  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  53.33 
 
 
372 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  52.21 
 
 
370 aa  355  7.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  51.13 
 
 
363 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  51.13 
 
 
363 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  52.21 
 
 
372 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  48.77 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  48.77 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
373 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  51.23 
 
 
371 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  52.07 
 
 
380 aa  349  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  46.99 
 
 
370 aa  349  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  48.75 
 
 
371 aa  349  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  49.31 
 
 
372 aa  348  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  50.69 
 
 
370 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  49.58 
 
 
365 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  49.04 
 
 
366 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
371 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2017  alanine dehydrogenase  54.14 
 
 
380 aa  346  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.02834  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 
377 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
371 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
371 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 
368 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  51.66 
 
 
371 aa  345  5e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  50.96 
 
 
371 aa  346  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  50.69 
 
 
371 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  50.69 
 
 
371 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 
371 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  51.24 
 
 
372 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 
371 aa  343  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  51.24 
 
 
372 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 
371 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  49.17 
 
 
371 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  50 
 
 
360 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  52.42 
 
 
361 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  54.95 
 
 
367 aa  341  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  48.35 
 
 
371 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  50.69 
 
 
370 aa  341  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  51.24 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  52.34 
 
 
373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  52.34 
 
 
373 aa  339  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  48.75 
 
 
376 aa  339  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  51.51 
 
 
371 aa  339  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  54.97 
 
 
368 aa  339  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  49.44 
 
 
366 aa  337  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  51.13 
 
 
362 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  47.27 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  50 
 
 
373 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  51.4 
 
 
360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  52.04 
 
 
368 aa  336  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>