271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0658 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  59.28 
 
 
335 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  55.17 
 
 
324 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  53.33 
 
 
320 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  51.58 
 
 
314 aa  322  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  51.46 
 
 
314 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  50.5 
 
 
318 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  38.28 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  38.54 
 
 
326 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.46 
 
 
309 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.32 
 
 
331 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  38.21 
 
 
308 aa  218  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  37.71 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  34.55 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  36.16 
 
 
314 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  38.89 
 
 
362 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  39.4 
 
 
362 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  38.34 
 
 
354 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  38.49 
 
 
354 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  40.06 
 
 
354 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.61 
 
 
361 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  37.46 
 
 
315 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.31 
 
 
386 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  38.11 
 
 
379 aa  202  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  38.24 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  38.36 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  38.14 
 
 
379 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 
384 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 
384 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 
384 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 
384 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 
384 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  38.11 
 
 
379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  38.56 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  38.14 
 
 
379 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  38.14 
 
 
379 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  38.14 
 
 
379 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  38.14 
 
 
379 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  38.14 
 
 
379 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  38.14 
 
 
379 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  38.14 
 
 
379 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  36.18 
 
 
366 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  38.14 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.72 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.44 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  37.14 
 
 
398 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.51 
 
 
354 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  38.67 
 
 
438 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  37.54 
 
 
415 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.13 
 
 
397 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  35.14 
 
 
347 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.18 
 
 
354 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  37.12 
 
 
380 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  38.49 
 
 
385 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38.33 
 
 
373 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  35.29 
 
 
385 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  36.51 
 
 
387 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  37.78 
 
 
385 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.72 
 
 
379 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  34.97 
 
 
393 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  38.82 
 
 
363 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.67 
 
 
349 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.57 
 
 
343 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
411 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
379 aa  188  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  36 
 
 
369 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  38.49 
 
 
368 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  35.47 
 
 
343 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
391 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  34.64 
 
 
383 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  36.56 
 
 
382 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0521  iron-sulfur cluster binding protein  34.4 
 
 
430 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585197  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  36.11 
 
 
409 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  37.17 
 
 
372 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  34.82 
 
 
383 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.45 
 
 
382 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  36.42 
 
 
404 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
393 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3861  iron-sulfur cluster-binding protein  38.36 
 
 
393 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
395 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.62 
 
 
368 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.44 
 
 
382 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  37.87 
 
 
379 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  35.44 
 
 
411 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  35.14 
 
 
345 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.16 
 
 
375 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  36.56 
 
 
383 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  35.8 
 
 
409 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 
400 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  33.55 
 
 
383 aa  185  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 
393 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.8 
 
 
409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  35.37 
 
 
360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.8 
 
 
409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  35.63 
 
 
382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.8 
 
 
409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.8 
 
 
409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.05 
 
 
387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.8 
 
 
409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>