More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0734 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  867    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  74 
 
 		 423 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  71.16 
 
 		 423 aa  630  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 423 aa  565  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  61.85 
 
 		 424 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 423 aa  534  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 430 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  54.01 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 426 aa  364  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 439 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 423 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 431 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 430 aa  346  5e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 442 aa  345  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 427 aa  345  7e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 442 aa  345  7e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 428 aa  345  8.999999999999999e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 414 aa  345  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 438 aa  343  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 468 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 423 aa  342  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 422 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 422 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 427 aa  339  5e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 432 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 425 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 435 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 432 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 421 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 427 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 424 aa  332  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3651  seryl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003876  seryl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00729663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 425 aa  329  7e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 413 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0839  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 430 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 430 aa  326  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 426 aa  326  6e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 427 aa  325  9e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>