211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1942 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 383 aa  788    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.17 
 
 		 374 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 		 379 aa  509  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 374 aa  503  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 381 aa  348  8e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 370 aa  338  7e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  41.45 
 
 		 484 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  37.66 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 361 aa  245  9e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 407 aa  240  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  36.5 
 
 		 641 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  36.69 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  27.49 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 537 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 542 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 540 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 534 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  27.56 
 
 		 570 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  41.82 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  42.15 
 
 		 418 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 325 aa  86.3  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  26.25 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 329 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.16 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 327 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.39 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.55 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.41 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.43 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.88 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.22 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.3 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.17 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.44 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  24.6 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.61 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.34 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>