40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1249 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  100 
 
 		 366 aa  708    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 408 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  33.43 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  33.43 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 413 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  28.32 
 
 		 468 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  23.84 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 410 aa  53.1  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  22 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 		 381 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 416 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>