274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0629 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  44.44 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  42.6 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  42.22 
 
 
217 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  42.03 
 
 
217 aa  148  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  39.55 
 
 
226 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  38.36 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  36.56 
 
 
234 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  37.24 
 
 
236 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  38.8 
 
 
232 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  35.9 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  36.56 
 
 
227 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  35.19 
 
 
235 aa  118  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  32.19 
 
 
225 aa  115  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  36.61 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  32.91 
 
 
225 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  32.48 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  34.78 
 
 
242 aa  108  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  33.04 
 
 
223 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  33.05 
 
 
225 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  32.19 
 
 
225 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  33.18 
 
 
239 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  31.33 
 
 
225 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  32.11 
 
 
233 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  31.52 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  33.71 
 
 
234 aa  98.2  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  31.96 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  33.17 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  33.16 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  25.86 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  25.21 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  26.03 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  25.97 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  25.44 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  24.79 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  24.68 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  25.82 
 
 
252 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  24.7 
 
 
251 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  26.94 
 
 
242 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  25.21 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  22.22 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  23.72 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  24.08 
 
 
279 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  25.6 
 
 
235 aa  58.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  23.53 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  24.29 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  22.55 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  23.28 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  25.14 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1865  uridylate kinase  22.57 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0872055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0996  uridylate kinase  22.78 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.405084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  26.98 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  27.32 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  26.47 
 
 
263 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  22.31 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  25.62 
 
 
245 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  24.79 
 
 
245 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  25.82 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  24.28 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  26.12 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  25.2 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  23.55 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  23.55 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  25 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  25.31 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  23.87 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  24.79 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  21.21 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  23.44 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2035  uridylate kinase  24.66 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  25.63 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  22.13 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  24.79 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  25.21 
 
 
247 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  26.24 
 
 
244 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  24.79 
 
 
242 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  24.38 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2349  uridylate kinase  24.2 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  24.26 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  24.38 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  24.38 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  22.64 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  23.77 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  24.38 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1383  uridylate kinase  24.24 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.862612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  24.38 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  24.38 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2075  uridylate kinase  24.2 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.433019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0631  uridylate kinase  24.18 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  24.44 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  24.38 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  24.62 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  22.73 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  23.97 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  23.28 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  24.48 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  21.03 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  24.69 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  26.32 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1538  uridylate kinase  24.59 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>