More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0303 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0303  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
361 aa  707    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.594505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2275  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.17 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0754968  normal  0.291328 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0328  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.38 
 
 
320 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.57 
 
 
324 aa  236  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1633  NADH dehydrogenase subunit H  40.19 
 
 
350 aa  227  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1082  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.9 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.524281  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0515  NADH dehydrogenase subunit H  40.06 
 
 
341 aa  218  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1793  NADH dehydrogenase (quinone)  38.98 
 
 
320 aa  216  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.096157  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0658  NADH dehydrogenase subunit H  40.19 
 
 
349 aa  216  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0646  NADH dehydrogenase subunit H  40.19 
 
 
343 aa  206  5e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1301  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  37.84 
 
 
352 aa  196  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1898  NADH dehydrogenase subunit H  35.26 
 
 
352 aa  196  7e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180885  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  34.11 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  33.11 
 
 
353 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  31.56 
 
 
353 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.61 
 
 
349 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.59 
 
 
329 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  31.7 
 
 
322 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.69 
 
 
348 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.97 
 
 
359 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  29.87 
 
 
352 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 
336 aa  149  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  28.4 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.74 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.32 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  29.3 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  29.08 
 
 
358 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  29.36 
 
 
354 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  29.36 
 
 
354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  29.22 
 
 
354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.19 
 
 
360 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  30.45 
 
 
372 aa  146  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
341 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  29.43 
 
 
432 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  32.09 
 
 
354 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  30.74 
 
 
354 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.74 
 
 
358 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  30.77 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  30.77 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  30.77 
 
 
352 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  30.77 
 
 
333 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  31.09 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  29.74 
 
 
358 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  30.77 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  30.77 
 
 
352 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  30.69 
 
 
341 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  30.69 
 
 
341 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  30.77 
 
 
352 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  28.44 
 
 
354 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  27.83 
 
 
354 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  30.15 
 
 
384 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  31.33 
 
 
330 aa  143  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  30.17 
 
 
355 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  30.17 
 
 
355 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  32.81 
 
 
372 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  30.17 
 
 
355 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  32.11 
 
 
354 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  28.9 
 
 
368 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  29.97 
 
 
355 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 
358 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.98 
 
 
344 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  29.97 
 
 
355 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  31.02 
 
 
372 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  29.97 
 
 
355 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  32.5 
 
 
372 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  30.66 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  29.49 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  31.68 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.86 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.08 
 
 
366 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 
341 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  30.56 
 
 
372 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  30.66 
 
 
372 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  30.63 
 
 
372 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  30.03 
 
 
372 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0747  NADH dehydrogenase (quinone)  29.72 
 
 
342 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
338 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.39 
 
 
331 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.88 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.04 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  27.8 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  29.43 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  29.43 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  29.43 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  29.43 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  29.43 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  29.72 
 
 
384 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  29.43 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  29.43 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  29.43 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  29.1 
 
 
333 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  28.86 
 
 
333 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  28.86 
 
 
333 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.03 
 
 
331 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  30.37 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.3 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.64 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  29.21 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.88 
 
 
349 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>