241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0897 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 		 365 aa  748    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.15 
 
 		 370 aa  566  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.39 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  72.83 
 
 		 369 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.83 
 
 		 365 aa  531  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  70.65 
 
 		 372 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  71.43 
 
 		 366 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.78 
 
 		 392 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.71 
 
 		 411 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.67 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.05 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.43 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.7 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.36 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.17 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.74 
 
 		 329 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  46.43 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.84 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.43 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  42.76 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.31 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.33 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.34 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.25 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.85 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.52 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.56 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.35 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  40.68 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  45.41 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  39.54 
 
 		 290 aa  172  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  40.15 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  47.4 
 
 		 276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  39.85 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  38.93 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  39.69 
 
 		 280 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  39.45 
 
 		 251 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  39.38 
 
 		 731 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  38.78 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  35.71 
 
 		 273 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  48.17 
 
 		 270 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  37.16 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  41.52 
 
 		 268 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37.93 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  46.6 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  39.39 
 
 		 274 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  43.18 
 
 		 273 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  39.23 
 
 		 274 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  40.85 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  34.64 
 
 		 273 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  39.02 
 
 		 274 aa  159  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  42.73 
 
 		 273 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  45.55 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.52 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  40.31 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.33 
 
 		 275 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.52 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.78 
 
 		 275 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  39.23 
 
 		 274 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  39.23 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  37.46 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.33 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.23 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  37.79 
 
 		 278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  36.88 
 
 		 274 aa  156  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  37.21 
 
 		 288 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  38.85 
 
 		 274 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  38.46 
 
 		 274 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  37.14 
 
 		 276 aa  156  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.1 
 
 		 312 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  43.52 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  38.08 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.18 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  34.62 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  36.92 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  36.05 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40 
 
 		 297 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  33.8 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  35.13 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0741  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.82 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  42.2 
 
 		 254 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  36.58 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3478  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  42.15 
 
 		 273 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.13 
 
 		 248 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.15 
 
 		 284 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  33.45 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  42.66 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1872  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37.14 
 
 		 296 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  37.6 
 
 		 275 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05971  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37.14 
 
 		 296 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.848004  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  35.14 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  36.58 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  39.07 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  39.07 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0543  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  35.46 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06071  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  35.46 
 
 		 295 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.817258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  36.72 
 
 		 275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  39.45 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  37.16 
 
 		 276 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05991  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  35.46 
 
 		 295 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>