More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0288 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  100 
 
 
297 aa  607  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  100 
 
 
297 aa  607  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  94.61 
 
 
297 aa  577  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  83.95 
 
 
299 aa  518  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0158  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  79.93 
 
 
319 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.48 
 
 
312 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.52 
 
 
312 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6414  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.05 
 
 
301 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5358  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.91 
 
 
297 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1845  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.56 
 
 
297 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3721  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  71.82 
 
 
301 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0606642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.85 
 
 
297 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124271  normal  0.0880049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5280  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.85 
 
 
297 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0741  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.79 
 
 
296 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0543  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  70.21 
 
 
295 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06071  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  70.21 
 
 
295 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.817258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05691  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  70.21 
 
 
295 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05991  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  70.21 
 
 
295 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1316  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.91 
 
 
312 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.87 
 
 
312 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469245  hitchhiker  0.00416412 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  69.97 
 
 
296 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1872  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  69.28 
 
 
296 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1621  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  70.57 
 
 
299 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05971  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  69.28 
 
 
296 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.848004  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0620  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.01 
 
 
295 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000136812  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1634  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.34 
 
 
301 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.948044  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05451  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  68.94 
 
 
296 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.240538  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2039  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  71.63 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  55.43 
 
 
273 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.44 
 
 
276 aa  286  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.01 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.68 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.16 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.79 
 
 
275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.33 
 
 
275 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.79 
 
 
275 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3478  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.73 
 
 
273 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.59 
 
 
275 aa  276  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0791  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.37 
 
 
289 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0819  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.37 
 
 
289 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.147693  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2332  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.06 
 
 
307 aa  262  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3939  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.2 
 
 
286 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2306  light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.23 
 
 
288 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2375  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.61 
 
 
304 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1532  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.85 
 
 
288 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.185742  normal  0.0569964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1419  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.29 
 
 
286 aa  255  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  45.82 
 
 
731 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  41.2 
 
 
292 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  39.43 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  39.07 
 
 
292 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  40.37 
 
 
280 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  43.83 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  38.71 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  42.02 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  38.71 
 
 
313 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  40.3 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  40.22 
 
 
291 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  38.95 
 
 
278 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.42 
 
 
268 aa  176  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  40.66 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  42.17 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  42.45 
 
 
272 aa  171  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  39.55 
 
 
290 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  38.22 
 
 
273 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.16 
 
 
265 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  35.82 
 
 
264 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.57 
 
 
284 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  37.45 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  36.09 
 
 
276 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  41.63 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  36.94 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  38.29 
 
 
289 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  34.77 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  41.28 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  40.32 
 
 
251 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  41.03 
 
 
259 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  35.21 
 
 
276 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  36.44 
 
 
288 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  33.58 
 
 
276 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  36.99 
 
 
298 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  38.16 
 
 
275 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  36.96 
 
 
299 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  37.25 
 
 
272 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  35.32 
 
 
273 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  35.71 
 
 
299 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  36.19 
 
 
275 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  35.66 
 
 
283 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  36.09 
 
 
274 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  35.25 
 
 
289 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  34.94 
 
 
264 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  36.95 
 
 
289 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  36.18 
 
 
289 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  35.78 
 
 
297 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  35.32 
 
 
299 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  38.18 
 
 
728 aa  153  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  35.45 
 
 
275 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  36.69 
 
 
289 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  36.09 
 
 
274 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  33.33 
 
 
276 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.44 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>