130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0895 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0895  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 293 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.586988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0952  cytochrome c assembly protein  76.79 
 
 		 281 aa  441  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1425  HemX protein, putative  75.09 
 
 		 281 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1794  cytochrome c assembly protein  80.53 
 
 		 262 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1517  HemX protein, putative  61.03 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0935  cytochrome c assembly protein  63.21 
 
 		 282 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.685136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1537  cytochrome c assembly protein  64.15 
 
 		 281 aa  318  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000307971  hitchhiker  0.00260082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.55 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.89 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  26.7 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.74 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  29.58 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  28.87 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  28.87 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.59 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  29.26 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.94 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  27.74 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.01 
 
 		 454 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  23.31 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  25.56 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.68 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  22.96 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  26.81 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  27.17 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  26.99 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  24.4 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  25.56 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  24.48 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0579  cytochrome c assembly protein  22.55 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  23.63 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  22.86 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.48 
 
 		 395 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  31.93 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.84 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  24.88 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  30.25 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.29 
 
 		 390 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  31.09 
 
 		 407 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  24.46 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  31.11 
 
 		 379 aa  52.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  25.83 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.46 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  27.56 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  24.59 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.31 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.76 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  26.99 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  27.54 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  27.06 
 
 		 381 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 396 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.95 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.57 
 
 		 394 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  23.61 
 
 		 395 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  28.17 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.95 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.77 
 
 		 405 aa  49.3  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.18 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  24.64 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.89 
 
 		 405 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  28.26 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  24.29 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  23.19 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  23.19 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  23.19 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  28.57 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  26 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.54 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.57 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 408 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  23.53 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  22.46 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  24.79 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 403 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  28 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.45 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 401 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 		 378 aa  46.2  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2880  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  25.87 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  25.76 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0705  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.68 
 
 		 276 aa  45.8  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2890  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  25 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0734214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  26.98 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  30.68 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>