More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0767 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  100 
 
 		 403 aa  820    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  82.02 
 
 		 411 aa  676    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  85.47 
 
 		 406 aa  684    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  88.92 
 
 		 406 aa  716    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  77.72 
 
 		 406 aa  633  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  82.76 
 
 		 377 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  77.48 
 
 		 406 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  47.03 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.51 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  41.19 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  43.12 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  42.52 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  41.33 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  41.13 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  40.7 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  41.98 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  41.46 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  41.27 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  39.57 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  40.05 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  41.96 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  38.73 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  39.25 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  41 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  38.54 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  40.33 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  39.84 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  39.84 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  41.06 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  39.25 
 
 		 372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  39.67 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  42.16 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  39.52 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 371 aa  263  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  40.94 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  39.84 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  40.11 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  39.63 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  39.84 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  39.84 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  38.13 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  40.35 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  40.35 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  39.84 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  38.57 
 
 		 390 aa  259  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  38.98 
 
 		 377 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  39.79 
 
 		 371 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  42.13 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  39.89 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  39.84 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  38.38 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  41.07 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  39.79 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  40.16 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  38.71 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  39.89 
 
 		 370 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  37.87 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  38.99 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  37.04 
 
 		 376 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  38.29 
 
 		 370 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  41.6 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  44.89 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  37.93 
 
 		 371 aa  254  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  38.73 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  38.73 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  42.19 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  37.77 
 
 		 371 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  40.96 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  38.79 
 
 		 371 aa  252  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  38.54 
 
 		 371 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  38.54 
 
 		 371 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  37.84 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  38.96 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  38.54 
 
 		 371 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  40.75 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  37.89 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  43.77 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  38.81 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  41.56 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  38.54 
 
 		 371 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  38.81 
 
 		 371 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  38.4 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>