More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0582 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  100 
 
 		 282 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  66.31 
 
 		 283 aa  411  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  68.1 
 
 		 282 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  67.38 
 
 		 282 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  60.57 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0844  signal peptidase I  59.93 
 
 		 276 aa  346  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1173  signal peptidase I  59.72 
 
 		 285 aa  339  4e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.478468  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1037  signal peptidase I  59.35 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  54.58 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1114  peptidase S26A, signal peptidase I  46.62 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.747736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  33.46 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.86 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  34.24 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  34.24 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  34.36 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  34.36 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  33.72 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  35.51 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  35.39 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.72 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.55 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  34.77 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.33 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  31.78 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.33 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.77 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.33 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.33 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  33.74 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.94 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.12 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  35.51 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.21 
 
 		 288 aa  128  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  35.77 
 
 		 342 aa  128  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.69 
 
 		 305 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  35.06 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.29 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.29 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.94 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  30.99 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  36.64 
 
 		 247 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  33.47 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  29.51 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  36.64 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  32.94 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  33.07 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.88 
 
 		 322 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  34.52 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  33.33 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.46 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  32.79 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  32.38 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  34.35 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  29.31 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  32.92 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  35.1 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  33.82 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  33.82 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  33.82 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  33.82 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  36.44 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  33.82 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  33.07 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  35.22 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  35.34 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  34.07 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  34.07 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  34.07 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  34.07 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  34.07 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  34.4 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  31.78 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  31.7 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  32.56 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  31.34 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  33.58 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  31.76 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  33.7 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  31.32 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  33.7 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  30.28 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  34.41 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  33.7 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  33.33 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  31.65 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  32.44 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  31.32 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.89 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.89 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  34.82 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  31.91 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  32.84 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  35.12 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.02 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  31.37 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  35.12 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  30.85 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  31.64 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  33.61 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>