50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0350 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 199 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  87.82 
 
 		 199 aa  297  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  85.43 
 
 		 201 aa  295  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  80.71 
 
 		 197 aa  293  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  86 
 
 		 202 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  84 
 
 		 200 aa  292  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  85.28 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  83 
 
 		 200 aa  286  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  74.11 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  75.25 
 
 		 196 aa  248  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  71.21 
 
 		 198 aa  247  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  58.33 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  76.26 
 
 		 139 aa  194  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  52.51 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  41.11 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  41.11 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  41.11 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  45.22 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  39.81 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  39.66 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  36 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  35.6 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  31.6 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  31.31 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0607  hypothetical protein  90.38 
 
 		 79 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  33.5 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  36.7 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  35.78 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  32.86 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  31.47 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  33.17 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  32.68 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  34.17 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  34.17 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  31.03 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  37.04 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  33.16 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  35.29 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  31.17 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  27.41 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  28.11 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  28.11 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  30.32 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  32.39 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  40 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  28.74 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  29.41 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1729  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1820  permease cadmium resistance protein-like protein  21.93 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  31.96 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>