71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11260  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21820  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase  73.45 
 
 		 230 aa  341  5e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.137543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1680  hypothetical protein  53.74 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0799939  normal  0.0725804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3252  formate dehydrogenase gamma subunit  25.45 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0709  formate dehydrogenase gamma subunit  24.89 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3922  formate dehydrogenase, putative  24 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1927  formate dehydrogenase, putative  23.08 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3756  formate dehydrogenase gamma subunit  27.63 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3896  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.25 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3812  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.25 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4108  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.73 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4226  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.73 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4138  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.73 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0231  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.73 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.14 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0870  formate dehydrogenase gamma subunit  25.84 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  28.8 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4811  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.13 
 
 		 337 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3726  formate dehydrogenase gamma subunit  23.18 
 
 		 327 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3922  formate dehydrogenase gamma subunit  23.18 
 
 		 327 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3797  formate dehydrogenase gamma subunit  23.18 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2010  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0440  formate dehydrogenase, gamma subunit  19.79 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  25.66 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3327  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.91 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6558  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.94 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892588  hitchhiker  0.000719745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1816  formate dehydrogenase gamma subunit  27.65 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.621402  normal  0.0631982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.64 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0459  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.09 
 
 		 345 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  26.2 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.89 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0660  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.15 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0549126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3722  formate dehydrogenase gamma subunit  21.89 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.973901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3918  formate dehydrogenase gamma subunit  21.89 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3793  formate dehydrogenase gamma subunit  21.89 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2551  formate dehydrogenase gamma subunit  24.65 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233004  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4511  formate dehydrogenase, C subunit, putative  21.89 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0331  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.75 
 
 		 327 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.17 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.17 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3205  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.19 
 
 		 345 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0335  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.75 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.34 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  28.42 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0106  formate dehydrogenase, gamma subunit  20.45 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1823  formate dehydrogenase gamma subunit  24.71 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2091  formate dehydrogenase gamma subunit  23.5 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.92 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0102  formate dehydrogenase, gamma subunit  20.45 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4520  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.23 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  25.43 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0107  formate dehydrogenase, gamma subunit  21.49 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0391  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.22 
 
 		 345 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0423  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.22 
 
 		 345 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0104  formate dehydrogenase gamma subunit  22.61 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0061  formate dehydrogenase, gamma subunit  21.55 
 
 		 335 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0099  formate dehydrogenase gamma subunit  22.61 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4135  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.81 
 
 		 335 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4419  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.87 
 
 		 335 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4515  formate dehydrogenase, C subunit, putative  26.49 
 
 		 327 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4807  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.37 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4230  formate dehydrogenase, gamma subunit  25 
 
 		 327 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0104  formate dehydrogenase gamma subunit  22.63 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2425  formate dehydrogenase gamma subunit  25 
 
 		 369 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4415  formate dehydrogenase, C subunit, putative  24.82 
 
 		 328 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4112  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.17 
 
 		 327 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0227  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.17 
 
 		 327 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.227237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4142  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.17 
 
 		 327 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4127  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.82 
 
 		 327 aa  41.6  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  28.48 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  28.48 
 
 		 269 aa  41.6  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>