143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 175 aa  349  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  61.69 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  57.96 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  38.46 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  34.42 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  34.9 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  34.38 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  32.47 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  31.54 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.32 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.32 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.32 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  33.55 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.32 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.32 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  35.67 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  32.28 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.28 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.28 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.28 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.28 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.28 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  32.28 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  34.19 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  31.65 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  31.65 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.65 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  30.26 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.01 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  33.54 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.9 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  28.75 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  31.17 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.22 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.67 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  33.75 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  26.71 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  31.68 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  31.68 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  27.49 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  33.97 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  33.76 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  26.11 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  24.85 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  27.04 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  32.5 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  24.68 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  24.68 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  24.68 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  24.68 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  33.13 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  28.75 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  25.32 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  26.42 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  30 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  33.6 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  31.85 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  30.19 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  31.85 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  33.1 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  30 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  35.51 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  25.15 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  32.34 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  36.92 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  26.67 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  36.31 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  27.86 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  27.21 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  35.67 
 
 		 175 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  32.92 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.39 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  32.48 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  29.2 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  34.86 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.77 
 
 		 1053 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  32.39 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.85 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  29.41 
 
 		 201 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  28.18 
 
 		 137 aa  47.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.73 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  26.51 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  29.49 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  30.19 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  29 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  28.3 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  30.19 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.65 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  29.03 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>