289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  309  7.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  54.49 
 
 
156 aa  169  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  53.46 
 
 
165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  137  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  137  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  137  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  45 
 
 
167 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  43.83 
 
 
159 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  45 
 
 
167 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  43.21 
 
 
159 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  45.68 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  45.68 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  43.83 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  43.83 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  41.98 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 
159 aa  124  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
159 aa  123  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  43.12 
 
 
159 aa  123  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  43.12 
 
 
177 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
159 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  41.36 
 
 
159 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  41.36 
 
 
159 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
159 aa  120  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  42.41 
 
 
159 aa  120  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 
160 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  39.51 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  38.65 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  40.62 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  40.74 
 
 
159 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  38.27 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  40.27 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
159 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  38.27 
 
 
159 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  41.36 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  37.65 
 
 
159 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  39.62 
 
 
155 aa  110  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  40.49 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  36.42 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  38.65 
 
 
160 aa  107  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  40 
 
 
155 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  38.85 
 
 
154 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  38.04 
 
 
160 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  37.04 
 
 
159 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  41.94 
 
 
158 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  37.01 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  38.31 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  37.75 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  32.89 
 
 
152 aa  96.7  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  37.01 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
156 aa  93.2  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  35.71 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  36.31 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  35.71 
 
 
153 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  32.69 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  34 
 
 
147 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  35.57 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  33.76 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  32.47 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
155 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  37.24 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  30.13 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  35.86 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  34.39 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  48.11 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  34.23 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  32.28 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  38.68 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  32.91 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  30.38 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  33.75 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  31.48 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>