More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2469 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 626 aa  1291    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  42.74 
 
 		 607 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  40.06 
 
 		 624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  39.77 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  39.77 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.06 
 
 		 605 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  37.18 
 
 		 596 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  37.43 
 
 		 601 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.15 
 
 		 598 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.39 
 
 		 593 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.7 
 
 		 610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.24 
 
 		 610 aa  293  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.07 
 
 		 615 aa  283  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.15 
 
 		 590 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  33.4 
 
 		 590 aa  258  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.14 
 
 		 618 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.17 
 
 		 604 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.71 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  28.04 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.49 
 
 		 597 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.34 
 
 		 597 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.57 
 
 		 594 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.45 
 
 		 597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.65 
 
 		 438 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  37.6 
 
 		 243 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 		 536 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 		 536 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  24.2 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.88 
 
 		 555 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  31.84 
 
 		 557 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  23.28 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.21 
 
 		 558 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  49.11 
 
 		 112 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.43 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.62 
 
 		 554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  30.49 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.1 
 
 		 442 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.54 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  31.38 
 
 		 860 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.2 
 
 		 443 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.57 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  21.85 
 
 		 854 aa  104  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  31.95 
 
 		 903 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  24.07 
 
 		 872 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 892 aa  101  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.08 
 
 		 956 aa  101  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  31.39 
 
 		 874 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 858 aa  99.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  28.89 
 
 		 881 aa  99  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.23 
 
 		 864 aa  98.6  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  31.39 
 
 		 903 aa  98.2  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  30.2 
 
 		 852 aa  97.4  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 		 870 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 1088 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  29.25 
 
 		 871 aa  95.5  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  33.19 
 
 		 896 aa  94.4  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 846 aa  94  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  26.77 
 
 		 1085 aa  94  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  28.48 
 
 		 867 aa  94  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.21 
 
 		 423 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 855 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 		 887 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  23.81 
 
 		 793 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 		 890 aa  92  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 		 895 aa  92  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 		 892 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 		 892 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  29.09 
 
 		 856 aa  91.3  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  29.2 
 
 		 856 aa  91.3  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 		 890 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 917 aa  90.9  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  28.31 
 
 		 896 aa  90.9  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  27.02 
 
 		 857 aa  90.9  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  28.32 
 
 		 968 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 892 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 890 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 894 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  24.21 
 
 		 863 aa  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  29.3 
 
 		 1205 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 892 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 		 873 aa  90.1  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 892 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 892 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  28.64 
 
 		 918 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 		 875 aa  90.1  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  28.52 
 
 		 872 aa  89.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 846 aa  89.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 869 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  23.13 
 
 		 882 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 793 aa  89.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 891 aa  89.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  29.34 
 
 		 930 aa  89  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  26.4 
 
 		 893 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  27.23 
 
 		 868 aa  88.2  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  22.16 
 
 		 865 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  27.94 
 
 		 872 aa  88.6  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 870 aa  88.2  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  29.19 
 
 		 870 aa  87.4  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  29.19 
 
 		 870 aa  87.4  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 854 aa  87.4  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>