More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2595 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
130 aa  263  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  67.52 
 
 
126 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  65.81 
 
 
126 aa  163  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.48 
 
 
123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  63.79 
 
 
134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  61.74 
 
 
134 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  62.07 
 
 
134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  63.48 
 
 
134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.38 
 
 
126 aa  160  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  63.48 
 
 
134 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  65.52 
 
 
126 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  65.52 
 
 
126 aa  157  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.48 
 
 
119 aa  156  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  60.87 
 
 
134 aa  155  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  65.45 
 
 
125 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.1 
 
 
119 aa  148  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.7 
 
 
119 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.78 
 
 
141 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.12 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  53.39 
 
 
126 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  53.57 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  53.39 
 
 
168 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  48.67 
 
 
128 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
130 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
128 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.12 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.12 
 
 
118 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  47.41 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  51.69 
 
 
126 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  48.25 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  50.45 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  46.36 
 
 
130 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  47.27 
 
 
130 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  45.83 
 
 
242 aa  110  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  48.31 
 
 
119 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  42.61 
 
 
120 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  49.54 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  43.4 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.67 
 
 
123 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
110 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
110 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.02 
 
 
123 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  49.06 
 
 
107 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  40 
 
 
119 aa  105  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
107 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04050  iron ion transport-related protein, putative  42.98 
 
 
215 aa  100  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  38.71 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.73 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  44.34 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  43.4 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.17 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11154  predicted protein  43.81 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  43.4 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.17 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  45.28 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  43.4 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_9276  predicted protein  41.07 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0369403  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  44.23 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0667  HesB/YadR/YfhF  41.96 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0115559  normal  0.304199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
107 aa  95.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  44.86 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.17 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  43.4 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>