More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2349 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  100 
 
 
121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  78.05 
 
 
126 aa  193  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  76.27 
 
 
118 aa  186  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  76.27 
 
 
118 aa  185  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75.42 
 
 
118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  76.11 
 
 
117 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.57 
 
 
123 aa  177  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
119 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  49.56 
 
 
128 aa  120  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  50.91 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  48.18 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  46.9 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  47.66 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  48.18 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  46.9 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  44.86 
 
 
134 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.11 
 
 
123 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
126 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  47.71 
 
 
126 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  47.22 
 
 
128 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  46.02 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  46.73 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  44.86 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.94 
 
 
119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  46.79 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  48.11 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.12 
 
 
107 aa  106  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
111 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  40.87 
 
 
134 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
118 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1793  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
107 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.872961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
106 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
106 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  48.11 
 
 
119 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
115 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
110 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
110 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
113 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
109 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
115 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.15 
 
 
107 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  44.23 
 
 
106 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  40.54 
 
 
134 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.63 
 
 
106 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.63 
 
 
141 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.63 
 
 
107 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.15 
 
 
107 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  45.19 
 
 
107 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  43.27 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  44.66 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.66 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  44.66 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  44.66 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  44.66 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.38 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  44.66 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  44.66 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  44.66 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  44.66 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.72 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.72 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  42.31 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>