More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0103 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.95 
 
 
119 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  52.14 
 
 
126 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  51.28 
 
 
126 aa  141  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.75 
 
 
125 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.14 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  51.28 
 
 
126 aa  135  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  51.28 
 
 
126 aa  135  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  52.25 
 
 
134 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.13 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  52.68 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.35 
 
 
123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  49.11 
 
 
134 aa  130  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.01 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  48.65 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.12 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  50.89 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
130 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  47.46 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  47.46 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  46.85 
 
 
134 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  47.75 
 
 
134 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
119 aa  123  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  49.54 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  48.11 
 
 
117 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  44.55 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.55 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.64 
 
 
118 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.22 
 
 
123 aa  104  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
126 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
123 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  38.89 
 
 
119 aa  100  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  44.34 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  41.12 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  43.4 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  43.4 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  43.4 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  43.4 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  41.51 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2740  iron-sulfur cluster assembly protein  43.4 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  36.79 
 
 
242 aa  95.5  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  41.51 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  45.05 
 
 
119 aa  94.7  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1793  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.872961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  39.25 
 
 
113 aa  94.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  39.62 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  38.68 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
107 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.11 
 
 
108 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
122 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.96 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  37.74 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  39.62 
 
 
107 aa  92  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
107 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.79 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.09 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  37.96 
 
 
108 aa  92  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.32 
 
 
116 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  41.51 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>