More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2835 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 		 134 aa  276  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  81.34 
 
 		 134 aa  236  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  77.61 
 
 		 134 aa  228  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  78.36 
 
 		 134 aa  225  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  83.61 
 
 		 123 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  77.27 
 
 		 134 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  79.83 
 
 		 134 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.68 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  63.39 
 
 		 126 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  62.5 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.48 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.59 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.77 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.04 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.56 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  58.18 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  58.18 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  58.26 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.25 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  54.39 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  53.57 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  54.39 
 
 		 168 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.31 
 
 		 119 aa  130  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  51.79 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  50.89 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  49.11 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  51.33 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  50.91 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.09 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.22 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.97 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  45.05 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.88 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  46.85 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.593205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  44.09 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  46.96 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  44.86 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  40.32 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0631  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  41.07 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  45.19 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.57 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  40.57 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.44 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.44 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  41.51 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  39.45 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  41.51 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.09 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  40.38 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11154  predicted protein  42.86 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.32 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  42.59 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0408  HesB/YadR/YfhF  37.04 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.7 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  40.57 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.38 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.38 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.52 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  38.46 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1694  FeS assembly scaffold SufA  39.81 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.894129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.25 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  36.79 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_9276  predicted protein  41.44 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0369403  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.58 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>